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蛋白质组分析案例

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目录
1. 数据分析流程........................................................................................................ 3
2. 数据预处理............................................................................................................ 4
3. 蛋白质结果信息统计............................................................................................ 5
4. 实验质量评估........................................................................................................ 7
4.1. 蛋白质表达箱线图 ..................................................................................... 7
4.2. 蛋白质表达小提琴图 ................................................................................. 8
4.3. 蛋白质表达分布密度图 ............................................................................. 9
4.4. 蛋白质表达直方图 .................................................................................... 10
4.5. 样本聚类分析 ............................................................................................ 11
4.6. 表达相关性分析 ........................................................................................ 13
4.7. 主成分分析 ................................................................................................ 15
5. 全部蛋白质功能分析........................................................................................... 16
5.1. GO 功能分析 ............................................................................................. 16
5.2. KEGG 通路分析 ........................................................................................ 20
6. 差异蛋白分析...................................................................................................... 22
6.1. 差异蛋白筛选 ........................................................................................... 22
6.2. 差异蛋白的功能分析 ............................................................................... 23
6.2.1. GO 功能分析 .................................................................................. 24
6.2.2. KEGG 功能分析 ............................................................................. 27
6.3. 蛋白相互作用网络分析 ........................................................................... 28
6.4. 差异蛋白显示 ........................................................................................... 29
参考文献...................................................................................................................... 31
申明............................................................................................................................. 32
补充说明..................................................................................................................... 32